股票模拟软件本身并不直接涉及交易过程中的佣金问题，股票交易涉及开户、交易、结算等多个环节，而这些环节的费用通常由相关金融机构收取，在使用股票模拟软件进行投资时，是否需要支付佣金取决于具体的交易平台与金融机构的合作情况。

在选择股票模拟软件时，投资者应明确一点，应选择正规、信誉良好的平台，投资者应仔细阅读相关协议和条款，了解清楚软件的使用费用和服务内容，投资者还应保护自己的合法权益，避免被不合理的费用所困扰。

对于股票模拟软件提供的服务，除了行情查询、交易策略建议等辅助功能外，可能还包括其他增值服务，这些服务费用可能包含在软件使用费用中，在使用股票模拟软件进行投资时，投资者应明确清楚各项费用的构成，确保没有额外的费用产生。

投资者在使用股票模拟软件进行投资时，应保持警惕，选择正规、信誉良好的平台，并注意保护自己的合法权益，要确保所支付的佣金合理、透明，避免被不合理的费用所困扰。